La crise économique, ponctuée des prix de joueurs devenus irréalistes à la suite des folies dépensières de quelques clubs, ainsi que la loi du fair-play financier nouvellement instaurée par la FIFA auront finalement raison du club, obligé de recruter à moindres coûts. C’est à partir de l’arrivée de l’entraîneur Carlo Ancelotti en 2001, et des joueurs comme Rui Costa, Andrea Pirlo, Clarence Seedorf et Filippo Inzaghi dans l’effectif entre 2001 et 2002, que le club espère un renouveau. La saison suivante, la direction limoge Clarence Seedorf et engage Filippo Inzaghi, ancien joueur emblématique du club et ex-entraîneur de la Primavera. La défense redevient imperméable, grâce notamment à la charnière centrale Nesta – Thiago Silva, mélange d’expérience et de talent et d’un solide milieu de terrain sous l’impulsion de son capitaine, l’inépuisable Massimo Ambrosini, de l’arrivée importante de David Beckham pour la seconde partie de la saison, et enfin du retour en forme des autres cadres de cette équipe, notamment Clarence Seedorf et Andrea Pirlo.
L’efficacité offensive est retrouvée, notamment grâce au retour en forme du Brésilien Ronaldinho sur les ailes, motivé par la perspective de jouer en coupe du monde, et d’un duo offensif complémentaire devant lui: Alexandre Pato, et Marco Borriello dans le rôle de pivot après son regain de forme et sans oublier le joker Klaas-Jan Huntelaar. Il débuta en Coupe d’Italie le 8 novembre 2006 lors d’un match contre Brescia que le Milan AC remporta 4-2. Il joua aussi le match retour. Nuremberg clôturait la saison avec ce qui semblait être un match à domicile facile contre le SC Fribourg, qui était également confronté à la relégation. Au Brésil, être footballeur de première division est, pour la majorité, le seul moyen d’échapper à la pauvreté. Lucas Rodrigo Biglia, né le 30 janvier 1986 à Mercedes (Argentine), est un footballeur international argentin qui évolue au poste de milieu défensif au İstanbul Başakşehir. D’autre part, le très prometteur milieu offensif italo-égyptien Stephan El Shaarawy âgé de seulement 18 ans, est acheté au Genoa. Or, les blessures de Pato, la baisse de régime de Ronaldinho et le déséquilibre flagrant entre la défense, le milieu et l’attaque auront raison de l’association de ces quatre joueurs.
En effet, cette saison marquera un tournant, non seulement le club se sépare de ses cadres, mais aussi de manière surprenante de leurs attaquants et défenseur vedettes, respectivement Zlatan Ibrahimović, Antonio Cassano et Thiago Silva, puis des joueurs vieillissants Van Bommel et Zambrotta ou des moins convaincants Taiwo et Aquilani. En 1998, Alberto Zaccheroni (entraîneur venu d’Udinese Calcio), emmenant dans ses bagages le défenseur danois Helveg et l’attaquant allemand Oliver Bierhoff (récent meilleur buteur de la Série A), permet malgré tout de fêter dignement le centenaire du club qui remporte de nouveau un championnat. Pour pallier son plus gros problème de la saison écoulée, la profondeur du banc, l’équipe réalise un mercato important : Ronaldinho arrive en star du Barcelone, accompagné par Gianluca Zambrotta, Mathieu Flamini et Philippe Senderos d’Arsenal, Luca Antonini et Marco Borriello reviennent de leur copropriété, et enfin Christian Abbiati est rappelé de son prêt pour devenir le nouveau gardien titulaire en place d’un Dida désastreux la saison passée. À peine un an après l’avoir gagné, le club quitte la plus prestigieuse des compétitions européennes pour ne jouer que la Coupe UEFA.
Le Bayern se permet même d’afficher une affluence moyenne de 68 000 personnes en Ligue des champions, c’est-à-dire 100 %, le stade étant réduit de 3 000 places en configuration UEFA. Toutefois, le taux de chômage reste élevé (11,5 %) quoiqu’en net recul, comparé aux autres villes de l’Est de l’Allemagne et surtout par rapport à la moyenne fédérale de l’ordre de 6,5 % environ. L’affluence moyenne au Camp Nou en championnat est comprise entre 50 000 et 75 000 spectateurs, soit entre 55 et 80 % de la capacité maximale du stade. En 1984, un musée consacré au FC Barcelone et à son histoire ouvre ses portes au Camp Nou. Trophées exposés au musée du club. Néanmoins le club se redresse progressivement, ne cédant le titre en 1972 au Bayern Munich qu’en toute fin de parcours. Par ailleurs il s’agissait du premier titre de la future star Franco Baresi. Le premier but de Wolfsburg dans son enceinte est inscrit par Tomislav Marić sur pénalty. La religion demeure importante pour les habitants, comme en témoigne, par exemple, l’expression, pour saluer, « Grüss Gott » (« Dieu vous bénisse »).